东昌府区档案馆现有档案90个全宗（立档单位），档案门类齐全，馆藏丰富。门类包括文书档案、科技档案、会计档案、纪检档案、照片档案、声像档案、统计档案、土地档案、死亡干部档案、人口普查档案等10余种门类档案以及名人字画、文史资料、期刊报纸共计6.6万余卷（件）、册；现有馆藏档案进馆方式分为两种形式，一种是档案接收，依据国家档案法律法规的规定进行的强制性收集工作，主要接收区直各单位、乡镇办事处各门类档案；另一种是档案征集，个人、团体、社会组织无偿或有偿捐赠、代管的形式，征集到散存在社会上和个人手中反应本区历史有保存价值的档案资料。包括名人传记、名人字画、史志、史料、谱牒等多种形式。目前我馆馆藏档案最早于清朝中晚期，民国时期旧政权形成的档案也有一定数量保存，大部分馆藏主要是中华人民共和国建国后形成的档案，这些档案反映了不同历史时期我国政治、经济、军事、文化生活、历史、地理、农业、水利等方面的情况。比较珍贵的档案有清朝一甲头名状元----东昌府书法大家邓钟岳所书《爱莲说》、丰子恺画作《山清水秀》、海源阁藏书《嘉祐集》、清宣统圣旨以及民国时期、抗日战争、解放战争时期的书籍、报刊、老一辈革命家回忆录、山东省非物质文化遗产东昌毛笔以及制作工艺流程，东昌木版年画，清代光绪年间的族谱等等。